Investigación sobre el riesgo para la salud humana de la influenza aviar (influenza A H5N1) en Inglaterra: informe técnico 4

Actualizado el 2 de junio de 2023

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La Agencia de Seguridad Sanitaria del Reino Unido (UKHSA) está trabajando con la Agencia de Sanidad Animal y Vegetal (APHA), el Departamento de Medio Ambiente, Alimentación y Asuntos Rurales (Defra) y las agencias de salud pública de las 4 naciones para investigar el riesgo para la salud humana de influenza aviar (influenza A H5N1) en Inglaterra. Este informe se produce para compartir datos útiles para otros investigadores de salud pública y socios académicos que realizan trabajos relacionados. Incluye evidencia temprana y análisis preliminares que pueden estar sujetos a cambios.

Los datos informados en el resumen técnico son del 23 de mayo de 2023 (o como se especifica en el texto) para dar tiempo al análisis.

La evaluación de riesgos del Reino Unido se mantiene en el nivel 3 (transmisión limitada a mamíferos, nivel de confianza bajo) como se describe en el informe técnico anterior.

Tras la notificación de instalaciones avícolas infectadas con infección por el virus de la influenza A altamente patógena (HPAIV), UKHSA despliega el equipo de investigación rápida. El equipo obtiene el consentimiento de aquellos que están trabajando o presentes dentro de la línea del perímetro de bioseguridad, observa un hisopo de referencia (día 0) y proporciona hisopos para devolución postal los días 2, 5 y 8. El protocolo se publicará en GOV.UK a su debido tiempo.

El programa se lanzó en marzo de 2023. Al 23 de mayo de 2023, habían participado 85 personas de 5 sitios con brotes de influenza A (H5N1) en curso y actividades de sacrificio. Esto equivale al 70% de las personas que se sabe que han estado en el área de bioseguridad en esos sitios, incluidos los trabajadores agrícolas y los trabajadores adicionales que realizan la matanza selectiva.

Ciento veintidós personas fueron identificadas por haber estado dentro del área de bioseguridad en los 5 sitios incluidos hasta la fecha. De estos, 85 participaron en el programa de vigilancia. Se han confirmado dos detecciones humanas de influenza A (H5N1) 2.3.4.4b en un sitio.

El día 0 es el día del reclutamiento para el estudio y generalmente ocurre en un día en que el individuo está trabajando en las instalaciones infectadas. La influenza A se detectó en una sola muestra del día 0 tomada bajo supervisión fuera del perímetro de bioseguridad (no se detectaron los subtipos H1 y H3, H5 se detectó mediante la prueba de reacción en cadena de la polimerasa (PCR)). El cultivo del virus no tuvo éxito. El análisis genómico confirmó la influenza A (H5N1) 2.3.4.4b con el genoma parcial disponible compatible con AIV48.

Dos muestras posteriores de nariz y garganta en el día 2 (tomadas por uno mismo) y el día 3 (tomadas por un profesional de la salud) fueron negativas para la influenza A. El individuo permaneció asintomático en todo momento.

Los resultados hasta la fecha, en el contexto de la exposición del individuo en la granja el mismo día de la recolección del hisopo, sugieren que esta detección podría deberse a una contaminación temporal del tracto respiratorio superior adquirida a través de la exposición a aves infectadas o al entorno circundante, en lugar de que una infección sostenida.

El segundo individuo también fue reclutado durante un día de trabajo en las instalaciones infectadas, el día 0. Después de las pruebas negativas el día 0 y el día 2, el individuo recolectó 2 hisopos más autotomados el día 4 y el día 5 (no totalmente consistente con el protocolo ).

La influenza A se detectó mediante (RT)-PCR en tiempo real en las muestras del día 4 y el día 5 en 2 laboratorios UKHSA; la subtipificación fue negativa para H1 y H3, y positiva para H5, en 2 ensayos independientes específicos de H5 (Spackman et al., 2002; Slomka et al., 2007). Estas detecciones se acercaron al límite de detección (valor de umbral de ciclo (Ct) superior a 30). El cultivo del virus no tuvo éxito. Se secuenció un genoma completo y se confirmó influenza A (H5N1) 2.3.4.4b genotipo AIV48. Se recogió un hisopo adicional del individuo que dio negativo en la prueba de influenza A y H5.

El individuo permaneció asintomático en todo momento. Estos resultados se consideran de significado incierto, pero podrían ser compatibles con una infección, por lo que se tomaron medidas de precaución de salud pública.

Para la detección 1, se llevó a cabo la vigilancia pasiva de los contactos cercanos. Todos los contactos cercanos permanecieron clínicamente asintomáticos. Otros contactos fueron seguidos como parte del estudio.

Para la detección 2, se inició el rastreo de contactos de manera preventiva y los contactos se manejaron según su nivel de exposición al riesgo, incluida la vigilancia activa o pasiva, el aislamiento, los antivirales y las pruebas. Se identificaron veinte contactos. Todos permanecieron asintomáticos. Quince de los 20 contactos estaban accesibles para la prueba y todos dieron negativo.

La secuenciación del genoma viral se realizó en una muestra de aves de corral de la granja y las 2 detecciones humanas. Se produjeron datos de secuencia para los 8 segmentos para la muestra de aves de corral (Iniciativa global para compartir todos los datos de influenza (GISAID) número de acceso EPI_ISL_17657734) y la segunda detección humana, denominada detección 2 (GISAID EPI_ISL_17736649). Se generaron datos de secuencia parcial (segmentos de hemaglutinina (HA), neuraminidasa (NA) solamente) para la primera detección humana, denominada detección 1 (GISAID EPI_ISL_17736680).

El segmento HA estaba disponible para el caso aviar y ambas detecciones humanas. Los 3 se identificaron como clado 2.3.4.4b, que es el clado H5 HPAIV predominante actual que circula en el Reino Unido y en todo el mundo. Se pudo establecer el genotipo para la muestra aviar y la detección 2 ya que los 8 segmentos se secuenciaron con éxito. Estos se identificaron como genotipo AIV48, también conocido como genotipo similar a A/gull/France/22P015977/2022. El genotipo AIV48 se detectó por primera vez en el Reino Unido en junio de 2022, con detección de bajo nivel en Gran Bretaña (Inglaterra, Escocia y Gales) y Dependencias de la Corona (Isla de Man y Jersey) desde entonces, incluidos 25 casos de aves de corral, 3 aves cautivas o rehabilitadas, 11 aves silvestres y 2 mamíferos (zorros) para los que se dispone de datos de secuencia.

Los datos de secuencia disponibles para la detección 1 son consistentes con el genotipo AIV48 pero no pueden confirmarse debido a la falta de segmentos de genes.

Los datos de secuencia concatenados para todos los segmentos de los 2 genomas completos (aviar y detección 2) se colocaron en una filogenia con todas las secuencias del Reino Unido (diciembre de 2020 a abril de 2023) y GISAID H5N1 (noviembre de 2016 a abril de 2023). Las secuencias aviar y de detección 2 de la granja se encuentran dentro de un clado que contiene otros genomas AIV48 del Reino Unido, junto con otras secuencias europeas.

Las secuencias del genoma se compararon con el primer genoma AIV48 detectado en el Reino Unido (EPI_ISL_13782459: A/H5N1 A/chicken/England/085598/2022) para identificar las sustituciones de aminoácidos dentro de las secuencias. La secuencia aviar de esta granja avícola contiene 16 cambios de aminoácidos en comparación con la secuencia de referencia de AIV48, como se describe en la Tabla 1.

La secuencia de la detección 2 contiene todos los cambios no sinónimos presentes en el genoma de la muestra aviar, con una mutación adicional (NP: S310N) y en una ubicación, la secuencia no se puede llamar debido a una cobertura insuficiente (NA: N2S) ( Tabla 1). Los datos de secuencia parcial de la detección 1 también se revisaron y fueron consistentes con los otros 2 genomas donde hubo suficientes datos de secuencia. No se observaron mutaciones adicionales en los datos de secuencia disponibles para la detección 1.

Se espera variación dentro de cada genotipo; sin embargo, se están realizando más análisis y los datos se han compartido con socios de laboratorio para la evaluación de cualquier significado fenotípico.

Un guión (-) indica cobertura insuficiente en esa posición.

Un asterisco (*) indica una mutación que se ha identificado solo en la referencia de AIV48 y no en otros genomas de AIV48.

El subtipo dominante que circula entre las especies de aves en Inglaterra sigue siendo la influenza aviar altamente patógena (IAAP) A(H5N1).

Desde el comienzo de la temporada 2022 a 2023, APHA ha confirmado HPAI (H5N1) en especies de aves de corral en 154 instalaciones en Inglaterra y en aves silvestres de 526 ubicaciones. Desde la última actualización (datos entre el 15 de marzo de 2023 y el 23 de mayo de 2023) ha habido 6 nuevas instalaciones infectadas y detecciones en 68 ubicaciones de aves silvestres más. Se publica en línea más información sobre la última actualización de la situación de la influenza aviar en Inglaterra.

El número de detecciones en locales infectados sigue siendo relativamente bajo en comparación con el período anterior a la implementación de la orden de alojamiento. La frecuencia de detecciones de influenza aviar en aves silvestres es relativamente baja en comparación con los niveles al comienzo del período de notificación en 2022, pero ha mantenido su distribución geográfica en Inglaterra (Figuras 1a y 1b). La evaluación conjunta de DEFRA y APHA es que continúa habiendo un alto nivel de transmisión de influenza en aves silvestres en todo el Reino Unido.

Estos mapas contienen datos de Estadísticas Nacionales © Crown copyright and database right 2022.

Q4 (2022) = Trimestre 4 (1 de octubre de 2022 al 31 de diciembre de 2022)

Q1 (2023) = Trimestre 1 (1 de enero de 2023 al 31 de marzo de 2023)

Q2 (2023) = Trimestre 2 (del 1 de abril de 2023 al 30 de junio de 2023, corte de datos el 23 de mayo de 2023)

No hay datos complementarios disponibles para estas cifras para evitar la divulgación deductiva.

De 18 mamíferos salvajes analizados para la influenza A (H5N1) desde la última actualización (datos al 15 de marzo de 2023), no hubo nuevas detecciones de mamíferos en el Reino Unido. La vigilancia de APHA ha detectado influenza A(H5) en 23 de 247 mamíferos silvestres recolectados desde octubre de 2021 (Figura 2).

Los datos utilizados en este gráfico se pueden encontrar en la hoja de cálculo adjunta.

Hay informes continuos de detecciones en mamíferos a nivel internacional (Figura 3). Estos no parecen estar aumentando en frecuencia, aunque no existe un enfoque estandarizado para la vigilancia o la notificación.

Los datos utilizados en este gráfico se pueden encontrar en la hoja de cálculo adjunta. Los datos provienen de la base de datos de escaneo de inteligencia epidémica de infecciones emergentes y zoonosis de informes oficiales y no oficiales (incluidos los informes de los medios), que pueden incluir una pequeña cantidad de entradas duplicadas debido a información incompleta. La fecha del evento indica la fecha de recolección cuando se conoce, o la fecha de notificación cuando se desconoce la fecha de recolección.

La exposición humana a la influenza aviar se somete a una evaluación de riesgos por parte de los equipos de protección de la salud (HPT) de UKHSA. Estos equipos gestionan y registran las exposiciones en el sistema de información de brotes HPZone, como se detalla en informes técnicos anteriores.

Desde la última sesión informativa técnica, se ingresaron en HPZone otros 136 episodios de exposición en toda Inglaterra. La orientación sobre la interpretación de los datos de HPZone se ha publicado en resúmenes técnicos anteriores.

Los HPT también recopilan información utilizando formularios de vigilancia, como se describe en el informe técnico 1, con advertencias sobre la integridad y el retraso. Entre el 1 de octubre de 2022 y el 23 de mayo de 2023, se devolvió información para 283 (41,8 %) de los 677 incidentes de esta temporada (las personas pueden registrarse en más de un evento si están expuestas varias veces). Más de la mitad de los formularios de vigilancia recibidos de los HPT se relacionan con incidentes de aves silvestres (171 de 283 formularios devueltos). Los incidentes con aves silvestres a menudo involucran a menos individuos expuestos.

Se informó el uso de equipo de protección personal (EPP) en 730 (22,24 %) exposiciones. Se informó profilaxis antiviral para 305 (9,29 %) exposiciones. Para las personas que informaron síntomas similares a los de la gripe, se realizaron 51 hisopos sintomáticos (73,9% de los elegibles en esta categoría); todas las pruebas fueron reportadas como negativas para influenza A(H5).

La Organización Mundial de la Salud (OMS) ha notificado doce casos humanos de A(H5N1) desde diciembre de 2021. Esto incluye 3 casos nuevos desde el último informe técnico (2 detecciones en Inglaterra (ver sección 1) y un caso en Chile) . No se ha informado transmisión de persona a persona relacionada con estos casos. Consulte la Tabla 2 para obtener un resumen de los casos por país y clado.

Desde el último informe técnico, se informó un caso en Chile y otros 2 casos en Inglaterra, como se informó anteriormente. El caso de Chile fue grave y se informó que residía muy cerca de una gran mortandad de mamíferos marinos y aves. Los detalles sobre otros casos se pueden encontrar en resúmenes técnicos anteriores.

UKHSA continúa realizando un análisis del horizonte en busca de informes epidemiológicos relevantes para la influenza emergente en humanos y animales.

UKHSA recibe muestras clínicas positivas para la influenza remitidas por el NHS y los laboratorios regionales de salud pública (PHL) para la secuenciación del genoma completo, el aislamiento del virus y la caracterización antigénica durante todo el año. Esto se describe con más detalle en el informe técnico 1. Actualmente se está evaluando la sensibilidad de este sistema para detectar virus emergentes.

Entre el 3 de octubre de 2022 y el 31 de mayo de 2023, se remitieron a la Unidad de Virus Respiratorios de UKHSA 136 muestras que dieron positivo para influenza A y no subtipificables localmente o en laboratorios regionales. De estos, el 80 % (n=109) se caracterizaron como virus estacionales H1 o H3, con un 15 % (n=20) sin virus detectado y un 5 % (n=7) con una carga viral detectable pero insuficiente para lograr una subtipificación. resultado.

Datos relacionados con la vigilancia de la salud animal y las investigaciones que se llevan a cabo en Inglaterra obtenidos de la APHA. Esto incluye datos de vigilancia de aves silvestres, informes de enfermedades de declaración obligatoria en instalaciones infectadas y detecciones en mamíferos.

Los datos sobre los informes internacionales de mamíferos provienen de la base de datos de escaneo de inteligencia epidémica de infecciones emergentes y zoonosis de UKHSA de informes oficiales y no oficiales (incluidos los informes de los medios).

Los HPT de UKHSA completan los formularios de vigilancia para cada entorno confirmado (incluye entornos de aves de corral y aves silvestres); esto incluye el seguimiento de las personas expuestas y los detalles de la exposición. Los datos se mejoran con registros de laboratorio para pruebas respiratorias en poder de UKHSA.

Los detalles de las personas expuestas también se recopilan de HPZone, el sistema de gestión de casos de UKHSA.

Los datos de vigilancia internacional de casos humanos de influenza aviar son informados por la Organización Mundial de la Salud bajo las Regulaciones Sanitarias Internacionales y recopilados rutinariamente por UKHSA.

Rachel Abbey, Wendy Barclay, Paula Blomquist, Ian Brown, Alexander Byrne, Fernando Capelastegui, Lorenzo Cattarino, Meera Chand, Neil Cunningham, Eileen Gallagher, Natalie Groves, Berkin Hack, Katja Hoschler, Susan Hopkins, Kate Howell, Joe James, Angie Lackenby , Anissa Lakhani, Steven Riley, Anika Singanayagam, Nick Watkins.

El Grupo Técnico de Influenza Aviar incluye miembros con experiencia en enfermedades clínicas infecciosas, investigación clínica, epidemiología, genómica y virología:

Los autores agradecen a los equipos y grupos que proporcionaron datos para estos análisis, incluidos: