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Cita sugerida para este artículo
Aislamos 5 virus de influenza aviar altamente patógena A(H5N1) clado 2.3.4.4.b de heces de aves acuáticas silvestres en Corea del Sur durante noviembre de 2022. La secuenciación del genoma completo y el análisis filogenético revelaron nuevos genotipos producidos por reagrupamiento con virus de influenza aviar euroasiática de baja patogenicidad. Se requerirá una mayor vigilancia para mejorar las estrategias de prevención y control.
Los virus de la influenza aviar altamente patógena (HPAIV) han causado grandes pérdidas económicas en la industria avícola y son una gran amenaza para la salud pública. Desde la primera detección de HPAIV A(H5N1) de un ganso en 1996 en Guangdong, China, sus descendientes han evolucionado en múltiples clados (H0–H9) y subclades (1) específicos del gen de la hemaglutinina (HA) que causan epizootias intercontinentales (2) . Durante varias décadas, los HPAIV H5 han evolucionado en múltiples subtipos y genotipos generados por reagrupamiento con virus de influenza aviar de baja patogenicidad (LPAIV), lo que condujo a la aparición del clado 2.3.4.4 H5Nx HPAIV en el este de China durante 2013–2014 (3).
A mediados de 2016, se detectaron HPAIV reordenados H5N8 clado 2.3.4.4b que contenían genes internos de LPAIV de Eurasia en aves silvestres en el lago Uvs-Nuur en Rusia y el lago Qinghai en China (4); los virus causaron grandes brotes en Europa durante 2016-2017 (5). Posteriormente, se detectaron varios HPAIV H5N8 novedosos reordenados en Eurasia (5,6). A fines de 2020, se detectaron nuevos HPAIV del clado 2.3.4.4b H5N1 que se volvieron predominantes en Europa en aves de corral y aves silvestres (5).
Aislamos 5 HPAIV H5N1 de heces de aves silvestres recolectadas en Corea del Sur en noviembre de 2022 (Apéndice 1): A/Spot-billed_duck/Korea/K22-730-1/2022(H5N1) [K22-730-1], A/Wild_bird /Corea/K22-742/2022(H5N1) [K22-742], A/Spot-billed_duck/Corea/K22-856-2/2022(H5N1) [K22-856-2], A/Spot-billed_duck/Corea /K22-862-1/2022(H5N1) [K22-862-1], y A/Spot-billed_duck/Korea/K22-920/2022(H5N1) [K22-920] (Apéndice 1, Tabla 1). Para compartir rápidamente la información, realizamos la secuenciación del genoma completo de los aislamientos y depositamos las secuencias del genoma en la base de datos GISAID (https://www.gisaid.org).
Todos los aislados de H5N1 se clasificaron como HPAIV sobre la base de las secuencias de aminoácidos del sitio de escisión de HA (PLRPKRRKR/G). Los 5 aislamientos compartían identidades de secuencias de nucleótidos altas (99,4 % a ≈100 %) en los 8 genes de influenza, a excepción de la proteína básica de polimerasa 1 (PB1) aislada K22-920, proteína ácida de polimerasa (PA), nucleoproteína (NP) y genes no estructurales (NS) (93,0% a ≈99,0%). Los resultados de la búsqueda BLAST (https://blast.ncbi.nlm.nih.gov) mostraron que los genes de proteína HA, neuraminidasa y matriz (M) de todos los aislamientos tenían >99,1 % de identidades con 2021–2022 clado 2.3.4.4b HPAIV (Tabla 1). Los genes PB1, PA, NP y NS de todos los aislamientos fueron muy similares (98,72 %–99,52 %) a los LPAIV de 2019–2022 del este de Asia. Los genes PB1, PA, NP y NS de K22-920 fueron similares a los LPAIV de 2019–2020 de Corea del Sur, Rusia y Bangladesh (>98,4 %–99,3 %).
Figura 1
Figura 1. Análisis filogenético de nuevos virus de influenza aviar A(H5N1) clado 2.3.4.4b altamente patógenos encontrados en heces de aves silvestres en Corea del Sur, noviembre de 2022. A) Representación esquemática del origen de los virus aislados...
En análisis filogenéticos de máxima verosimilitud, los genes PB2, HA, neuraminidasa y M de los virus 5 H5N1 de Corea del Sur se agruparon con los de los virus descritos anteriormente como genotipo G10, identificados en China durante 2022–2023 (Apéndice 1 Figuras 1–8) ; G10 es un HPAIV H5N1 recombinante natural que contiene el gen PB2 de los LPAIV (7). genes PB1, PA, NP y NS de todos los virus H5N1 de Corea del Sur excepto K22-920 agrupados con los de LPAIV de Asia; esos segmentos de genes en K22-920 se agruparon por separado con otros LPAIV de Asia, incluidos Corea del Sur, Rusia y Bangladesh (Apéndice 1 Figuras 2, 3, 5, 8). La filogenia bayesiana del gen HA indicó que los virus H5N1 de Corea del Sur formaron un grupo bien respaldado; Se estimó que el tiempo hasta el ancestro común más reciente fue el 11 de agosto de 2022 (95 % de la densidad posterior más alta entre el 11 de junio y el 11 de octubre de 2022), lo que sugiere que es muy probable que los HPAIV H5N1 surgieran 1 o 2 meses antes de la migración otoñal de aves silvestres a Corea del Sur (Figura 1; Apéndice 1 Figura 9). Los aislamientos de Corea del Sur compartieron ascendencia común reciente con el virus A/Jiangsu/NJ210/2023(H5N1); el tiempo hasta el ancestro común más reciente entre ellos fue el 12 de abril de 2022 (95 % de densidad posterior más alta entre el 26 de diciembre de 2021 y el 28 de julio de 2022), lo que sugiere que los HPAIV H5N1 ancestrales habían estado circulando sin ser detectados durante ≈7 meses.
Los HPAIV H5N1 de Corea del Sur contenían aminoácidos en HA con afinidad de unión por los receptores de ácido siálico α-2,3 aviares (T118, V210, Q222 y G224) (numeración H5) (8,9). También tenían 2 sustituciones de aminoácidos HA, S113A y T156A, asociadas con una mayor afinidad de unión a los receptores de ácido siálico unidos a α-2,6 humanos (Apéndice 1, Tabla 2). Los 5 aislamientos tenían sustituciones de aminoácidos que incluían A515T en PA, que se sabe que aumenta la actividad de la polimerasa en células de mamíferos, y N30D, I43M, T215A en MP1 y L89V en PB2, que se sabe que aumentan la virulencia en ratones (Apéndice 1, Tablas 2, 3).
El reordenamiento de HPAI/LPAI de HPAIV H5Nx clado 2.3.4.4b creó un grupo genético diverso de virus H5 clado 2.3.4.4 que surgieron continuamente en varios países (1). El clado 2.3.4.4 H5N8 HPAIV aislado del lago Uvs-Nuur en Rusia tenía genes H3N8 LPAIV reagrupados de Mongolia (4). En Europa, los HPAIV identificados en 2020 (5,6) se produjeron por reordenamiento entre el clado 2.3.4.4b HPAIV y LPAIV de Eurasia. También se detectaron nuevos reordenamientos del clado 2.3.4.4 HPAIV y LPAIV de Eurasia en 2016 (10), durante 2020–2021 (Apéndice 1, referencia 1) y a finales de 2021 (Apéndice 1, referencia 2) en Corea del Sur. Teniendo en cuenta la aparición continua y la diseminación global de nuevos virus HPAI H5Nx del clado 2.3.4.4b reagrupados, se requerirá una vigilancia activa mejorada en animales salvajes y aves de corral domésticas para monitorear la introducción, diseminación y evolución de los HPAIV y proporcionar información para mejorar la prevención y el control. estrategias.
El Sr. Lee es candidato a doctorado en la Universidad de Konkuk, Seúl, Corea del Sur. Sus principales intereses de investigación se centran en la epidemiología molecular y las interacciones huésped-patógeno de los virus de la influenza aviar.
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Agradecemos a nuestros colegas de todo el mundo por sus contribuciones de laboratorio, que están disponibles a través de GISAID (Apéndice 2).
Esta investigación fue apoyada por el Programa de Desarrollo de Tecnología Médica y Bio de la Fundación Nacional de Investigación, financiada por el gobierno de Corea del Sur (subvención n.º NRF-2018M3A9H405635).
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Cita sugerida para este artículo: Lee SH, Cho AY, Kim TH, Ahn SJ, Song JH, Lee H, et al. Nuevo virus de influenza aviar altamente patógena A(H5N1) clado 2.3.4.4b en aves silvestres, Corea del Sur. Emergente Infect Dis. 2023 julio [fecha citada]. https://doi.org/10.3201/eid2907.221893
DOI: 10.3201/eid2907.221893
Fecha de publicación original: 19 de mayo de 2023
Índice – Volumen 29, Número 7—Julio de 2023
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Dong-Hun Lee, Laboratorio de Salud de Vida Silvestre, Facultad de Medicina Veterinaria, Universidad Konkuk, Seúl, Corea del Sur
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